MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187084	T	6	6	78	83	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187084	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187084	CAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187084	T	6	6	2491	2496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187084	TGA	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187084	GGA	2	6	6540	6545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187084	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187084	GGC	2	6	7561	7566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187084	TTTTC	2	10	7595	7604	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187084	ACG	2	6	7639	7644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187084	ATT	2	6	7648	7653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187084	T	6	6	9348	9353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187084	GGA	2	6	9365	9370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187084	AGCC	2	8	9449	9456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187084	CTG	2	6	10882	10887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187084	CGC	2	6	16808	16813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NT_187084	ACA	2	6	16822	16827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187084	GCG	2	6	16853	16858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187084	GCC	2	6	16862	16867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187084	TC	3	6	16887	16892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187084	CTT	2	6	16915	16920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187084	TTAGG	2	10	16925	16934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187084	TA	3	6	16953	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187084	GAA	2	6	18935	18940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187084	TGT	2	6	18954	18959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187084	ACA	2	6	19080	19085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187084	T	6	6	20446	20451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187084	AG	3	6	21789	21794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187084	A	7	7	21797	21803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187084	CTG	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187084	T	7	7	22963	22969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187084	TGA	2	6	23027	23032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187084	AAAGAT	2	12	23107	23118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187084	A	6	6	23133	23138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187084	AAC	2	6	23174	23179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187084	TTTGA	2	10	23204	23213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187084	ATT	2	6	23247	23252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187084	AGC	2	6	23280	23285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187084	TGT	2	6	23441	23446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187084	ATTT	2	8	23468	23475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187084	A	7	7	23507	23513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187084	TC	3	6	24955	24960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187084	A	6	6	24975	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187084	AGAA	2	8	25072	25079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187084	TGA	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187084	TGC	2	6	25659	25664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187084	A	7	7	25677	25683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187084	ACG	2	6	25696	25701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187084	TTA	2	6	25809	25814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187084	ACT	2	6	25829	25834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187084	AAT	2	6	25873	25878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187084	ATT	2	6	25891	25896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187084	AATA	2	8	25899	25906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187084	A	6	6	27155	27160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187084	ATA	2	6	27165	27170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187084	GCA	2	6	27174	27179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187084	A	6	6	27183	27188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187084	T	6	6	27193	27198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187084	ATA	2	6	27205	27210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187084	AGA	2	6	28855	28860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187084	AAC	2	6	30149	30154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.